Bāzes uz baitiem

Cilvēka genomu sekvencēšanas izmaksas krītas — vismodernākajos genomikas centros tās krītas piecas reizes ātrāk nekā skaitļošanas izmaksas. Arvien biežāk uzņēmumi un pētniecības laboratorijas veic DNS sekvencēšanu, meklējot norādes par ģenētiskajām variācijām un slimībām.

Taču nozarei ir jāizdomā, kā lēti uzglabāt visus iegūtos datus. Katrs no 3,2 miljardiem DNS bāzes pāru cilvēka genomā var tikt kodēts ar diviem bitiem — 800 megabaiti visam genomam. Bet ievērojami dati par katra bāze parasti tiek savākta, un gēni bieži tiek sekvencēti daudzas reizes, lai nodrošinātu precizitāti, tāpēc ir ierasts ietaupīt aptuveni 100 gigabaitus, veicot cilvēka genoma sekvencēšanu ar nozares līdera Illumina iekārtu. Lai saglabātu tik daudz datu par katru cilvēku uz planētas, būtu nepieciešams apmēram tikpat daudz digitālās atmiņas, cik visā pasaulē bija pieejams 2010. gadā.

Šis stāsts bija daļa no mūsu 2012. gada maija numura

• Skatiet pārējo izdevuma daļu
• Abonēt

Tad triks būs ietaupīt mazāk. Hārvardas ģenētiķis Džordžs Čērčs saka, ka galu galā būs jāsaglabā tikai atšķirības starp tikko sekvencētu genomu un atsauces genomu. Šo informāciju var iekodēt tikai četros megabaitos. Tad jūsu genoms varētu būt tikai vēl viens e-pasta pielikums.

Informācijas grafika, ko piedāvā Infographics.com

paslēpties