211service.com
Cilvēka genoms, kas piesārņots ar mikoplazmas DNS
Šī gada sākumā molekulārie biologi to paziņoja 20 procenti no necilvēku genomu datu bāzēm ir piesārņotas ar cilvēka DNS , iespējams, no pētniekiem, kuri sekvencēja paraugus.
Tagad pats cilvēka genoms ir kļuvis piesārņots. Bils Lengdons no Londonas Universitātes koledžas un Metjū Arno no Londonas Kings College saka, ka cilvēka genoma datubāzē ir atraduši sekvences no mikoplazmas baktērijām.
Šim piesārņojumam ir tālejošas sekas. Biotehnoloģiju uzņēmumi izmanto cilvēka genoma datubāzi, lai izveidotu DNS mikroshēmas, kas mēra cilvēka gēnu ekspresijas līmeni. Lengdons un Arno saka, ka ir atraduši mikoplazmas DNS divās komerciāli pieejamās cilvēka DNS mikroshēmās.
Ikviens, kas izmanto šīs mikroshēmas cilvēka gēnu ekspresijas mērīšanai, neapzināti mēra arī mikoplazmas gēnu ekspresiju.
Dažos veidos tas diez vai ir pārsteigums. Ir labi zināms, ka mikoplazmas piesārņojums ir izplatīts molekulārās bioloģijas laboratorijās, saka Lengdons un Arno. Ja veicas, šīs lietas atklāšana cilvēka genoma datubāzē koncentrēs prātus uz problēmu.
Galvenais jautājums ir šāda veida informācijas pārraides būtība. Šie mikoplazmas gēni nepārprotami veiksmīgi vairojas in silico. Viena iespēja ir tāda, ka mēs redzam pilnīgi jauna veida infekcijas ainavas sākumu.
Šeit gēni, kas var maskēties kā cilvēki (vai pat citi organismi), var veiksmīgi pārsūtīt sevi no vienas datu bāzes uz otru. Un, ja mēs to domājam kā virtuālu infekciju, mēs noteikti uztrauksim par virtuālo attīstību tuvākajā nākotnē.
Bet ko darīt? Piesārņojuma līmenis un veids, kādā tas izplatās, liecina, ka pētnieki zaudē cīņu par tā novēršanu. Mēs baidāmies, ka pašreizējie rīki būs nepietiekami, lai noķertu gēnus, kas ir pārsnieguši silīcija barjeru, viņi saka.
Visbiedējošākā ir iespēja, ka Lengdons un Arno ir tikai saskrāpējuši virsmu. Atrodot divas aizdomīgas DNS sekvences, šķiet, ka publicētajā cilvēka genoma secībā ir vairāk, viņi saka.
Ja virtuālā infekcija patiešām ir tik liela problēma, kā to iesaka Lengdons un Arno, mums, iespējams, vajadzēs aizsargāt datu bāzes ar pretvīrusu programmatūras genoma versiju, sava veida virtuālo imūnsistēmu.
Bet tas pats par sevi, visticamāk, izraisīs evolucionāru bruņošanās sacensību, kurā tiek atlasīti gēni, kas spēj pārspēt drošības pasākumus.
Skaidrs, ka šī ir nātre, kas ātri jāsatver. Tas ir, ja vēl nav par vēlu.
Atsauce: arxiv.org/abs/1106.4192 : Vairāk sapelējušu datu: cilvēka genoma virtuālā infekcija