211service.com
Eiropas gēnu karte
Zinātnieki ir pierādījuši, ka viņi var izmantot genoma analīzi, lai noteiktu cilvēka ģeogrāfisko izcelsmi tikai dažu simtu kilometru attālumā. Papildus tam, ka tiek piedāvātas iespējas pārbaudīt ģenētisko senču, pētījumi varētu arī būtiski ietekmēt gēnu lomu sarežģītās slimībās un citos uz genomu balstītos veselības pētījumos.
Gēnu karte: Eiropas ģenētiskā karte (augšpusē), salīdzinot ar tās ģeogrāfisko ekvivalentu (zemāk). Ģenētiskajā kartē katrs no 1387 indivīdiem ir attēlots ar krāsu un valsti atbilstoši visu četru viņu vecvecāku izcelsmes valstij. Uzzīmētie punkti ir saistīti viens ar otru, ņemot vērā 200 000 viena nukleotīda polimorfismu līdzību vai atšķirību — variācijas atsevišķos punktos visā genomā. Lielākas valstu etiķetes attēlo šo populāciju centrus atbilstoši to ģenētisko populāciju sadalījumam. Šķiet, ka šo centra punktu izvietojums precīzi atspoguļo iesaistīto valstu ģeogrāfiskās pozīcijas.
Uzzīmējot atšķirības starp 3000 eiropiešu ģenētiskajām variācijām divdimensiju režģī, pētnieki varēja atklāt modeli, kas ļoti līdzinās Eiropai. Zinātnieku vidū bija Kornela universitātes pētnieki; Kalifornijas Universitāte Losandželosā (UCLA); Čikāgas Universitāte; un Lozannas Universitātē Šveicē. Secinājumi parādās šīs nedēļas numurā Daba .
Citi nesen ir publicējuši līdzīgus pētījumus Pašreizējā bioloģija , saka Jānis novembris , līdzautors Daba papīrs un docents UCLA. Taču jaunākais pētījums sniedzas tālāk, izmantojot algoritmus, lai ar augstu precizitātes pakāpi mēģinātu paredzēt personas ģeogrāfisko izcelsmi, pamatojoties tikai uz viņa vai viņas ģenētiskajām variācijām. Zinātnieki pat spēja atklāt izcelsmes modeļus, kas atšķir franču, vācu un itāļu valodā runājošās grupas Šveicē.
Daudzos aspektos rezultāti nemaz nav pārsteidzoši, saka Mihaels Kravčaks Ķīles Kristiāna-Albrehta universitātes Medicīnas informātikas un statistikas institūta, Vācijā, kurš piedalījās Pašreizējā bioloģija pētījums. Viņš saka, ka bija labi zināms, ka, jo tālāk atrodas divu cilvēku izcelsme, jo atšķirīgāki būs viņu gēni. Bet tas nekad iepriekš nebija parādīts genoma līmenī.
Viens no iemesliem, kāpēc tas tagad ir iespējams, ir genotipēšanas izmaksu samazināšanās, saka Novembre. The Affymetrix Viņš saka, ka GeneChip mēra 500 000 viena nukleotīda polimorfismu (SNP) — variācijas vienā genoma punktā — tikai par dažiem simtiem dolāru.
Ģenētiskie paraugi tika izvēlēti, lai iekļautu personas, kuru ģeogrāfisko izcelsmi varēja noteikt, pamatojoties uz to, ka visi četri vecvecāki nāk no vienas valsts.
Pēc tam pētnieki izveidoja divdimensiju karti ar indivīdiem, kas novietoti atkarībā no tā, cik līdzīgi vai cik viņi atšķiras no visiem pārējiem. Krāsu kodēšana, lai parādītu, no kurienes ir katrs no viņu vecvecākiem, rezultāti ir pārliecinoši, skaidri parādot Eiropas formu un robežas.
Viena no šāda veida darba motivācijām ir palīdzēt ģenētiskajai epidemioloģijai vai populācijas mēroga ģenētiskajiem pētījumiem. Patiešām, tas ir viens no galvenajiem mērķiem Glakso Smits-Kline , kas piedalās pētījumā, stāsta Novembre. Viņš saka, ka viņi ir ieinteresēti farmakoģenētiskos nolūkos, lai veiktu zāļu blakusparādību gadījumu kontroles pētījumus.
Ideja ir ietaupīt naudu šajos liela mēroga ģenētiskajos epidemioloģiskajos pētījumos, saka Krawczak. Cilvēku genotipa noteikšana ir ļoti dārga. Bet, ja jūs varat izveidot ģenētiskās kontroles grupas dažādām populācijām, tas ļauj vieglāk pārbaudīt zāles pret dažādām populācijām, lai noskaidrotu, kur ir ieguvumi, viņš saka.
Pašlaik galvenā uzmanība tiek pievērsta Eiropai, jo tai ir daudz ģenētisko variāciju, bet salīdzinoši labi definēta un iezīmēta vēsture. Tas ir murgs veikt populācijas ģenētiku Amerikā, saka Krawczak. Ir tik daudz migrantu no dažādām pasaules daļām, ka tas ir pārāk sarežģīti.
Tomēr Novembre saka, ka viņš plāno paplašināt šāda veida pētījumus, lai aptvertu lielākas pasaules daļas un jauktu senču indivīdus. Pašlaik, ja jums ir jaukti vecvecāku senči, jūs atrodaties starp valstīm, no kurām nāk vecvecāki, viņš saka. Tātad, ja tie ir daļēji itāļi un daļēji briti, tie parādītos Šveicē. Bet mēs strādājam pie algoritmiem, kas spēs secināt vecvecāku izcelsmi un apiet to.
Galu galā šāda veida pētījumus, visticamāk, veiks arvien vairāk uzņēmumu, kas piedāvā DNS mājas testus internetā cilvēkiem, kuri vēlas izsekot savai ģenealoģijai. Šobrīd šie pakalpojumi mēdz piedāvāt diezgan aptuvenus attēlus par cilvēka izcelsmi. Bet, tā kā microarray tehnoloģija kļūst lētāka un statistikas programmatūra, ko izmanto tās kartēšanai, kļūst sarežģītāka, šāda veida pakalpojumiem vajadzētu ievērojami uzlaboties, saka Novembre.