Illumina mēģinājums uzveikt vēzi ar DNS testiem

Pasaulē lielākā DNS sekvencēšanas kompānija saka, ka tā izveidos jaunu uzņēmumu, lai izstrādātu asins analīzes, kas maksā 1000 USD vai mazāk un var atklāt daudzus vēža veidus pirms simptomu parādīšanās.

Illumina, kas atrodas Sandjego, paziņoja, ka tās asins analīzēm vajadzētu nonākt tirgū līdz 2019. gadam, un tās tiks piedāvātas, izmantojot ārstu birojus vai, iespējams, testēšanas centru tīklu.

Atdalītā uzņēmuma nosaukums Grāls atspoguļo pieaugošās cerības saistībā ar jauniem DNS testu veidiem, kas varētu palīdzēt vēža uzveikšanai vairāk nekā vairāk nekā 90 miljardi ASV dolāru, ko ārsti un slimnīcas katru gadu iztērē pretvēža zālēm. Illumina izpilddirektors Džejs Flatlijs saka, ka viņš cer, ka testi varētu būt pagrieziena punkts karā pret vēzi.

Jaunuzņēmums atradīsies Sanfrancisko un ir piesaistījis vairāk nekā 100 miljonus USD no Illumina, kā arī no Bila Geitsa, Džefa Bezosa riska fonda, Bezos Expeditions un Arch Venture Partners. Illumina saglabās vairākuma kontroli.

Illumina īstenotā testēšanas koncepcija, ko dažreiz sauc par šķidro biopsiju, ir izmantot liela ātruma DNS sekvencēšanas iekārtas, lai iztīrītu cilvēka asinis, lai atrastu vēža šūnu atbrīvotos DNS fragmentus. Ja ir DNS ar vēzi izraisošām mutācijām, tas bieži norāda, ka audzējs jau veidojas, pat ja tas ir pārāk mazs, lai izraisītu simptomus vai būtu redzams attēlveidošanas aparātā.

Illumina neizgudroja ideju testiem, kurus vispirms izstrādāja akadēmiskie centri, tostarp Džona Hopkinsa universitātē (skat. Vēža noteikšana asins flakonā) un Honkongā (sk. Šķidrā biopsija). Bet Flatley saka, ka tikai nesen gēnu sekvencēšana ir kļuvusi pietiekami lēta, lai mēģinātu padarīt vēža skrīninga testus par pieņemamu cenu.

Illumina, kas atrodas Sandjego, Silīcija ielejā ir nodibinājis filiāles, lai risinātu DNS datu patērētāju tirgus.

DNS tests, kas spēj noteikt dažādus vēža veidus, varētu būt revolucionārs, jo agri konstatētus audzējus bieži var izārstēt ar operāciju vai starojumu. Kopš 1970. gadiem lielākais vēža izraisīto nāves gadījumu skaita samazinājums ir saistīts vai nu ar uzvedības izmaiņām, piemēram, tabakas lietošanas samazināšanos, vai arī ar efektīvām skrīninga pārbaudēm, galvenokārt kolonoskopijām un papīru uztriepi. Arī jaunas zāles ir palīdzējušas, lai gan to ietekme uz izdzīvošanu kopumā ir bijusi neliela.

Cerības, ka vēža asins analīzes ātri pārvērtīsies par vairāku miljardu dolāru nozari, ir izraisījušas arvien lielāku investoru interesi. Piemēram, pagājušajā nedēļā startup ar nosaukumu Guardant, ko vadīja bijušie Illumina vadītāji, arī paziņoja, ka ir piesaistījis 100 miljonus USD.

Guardant tests nav agrīnas noteikšanas tests, bet gan tiek izmantots, lai izmērītu audzēja DNS pacientiem, kuri jau cīnās ar vēzi, un to var nozīmēt invazīvas audu biopsijas vietā (skatiet Lielo vēža testa eksperimentu). Citi uzņēmumi, kas pretendē uz daļu testēšanas tirgus, ir Personal Genome Diagnostics, Džona Hopkinsa universitātes atdalītais uzņēmums, kā arī Trovagene, Boreal Genomics un Natera.

ASV tirgū vienīgais agrīnās noteikšanas šķidruma biopsijas tests ir no Pathway Genomics, un tas maksā 699 USD. Bet, tā kā joprojām nav skaidrs, cik labi šāda veida testi darbojas, šis uzņēmums saņēma brīdinājuma vēstuli no ASV Pārtikas un zāļu pārvaldes, kurā tika apšaubīti tā mārketinga apgalvojumi (skatiet sadaļu Kāpēc jums nevajadzētu uztraukties ar 699 USD vēža testu).

Džejs Flatlijs, Illumina izpilddirektors, ar DNS sekvencēšanas iekārtu. Illumina sekvenceri veido lielāko daļu visā pasaulē ģenerēto DNS datu.

Jebkurš presimptomātiskas vēža skrīninga testa izstrādātājs saskaras ar biedējošiem šķēršļiem. Cik bieži pārbaudē tiks atklāts vēzis un cik bieži tas sniegs nepareizu rezultātu? Turklāt pat testi, kas atklāj vēzi agrīnā stadijā, var pārvērsties par medicīnisku katastrofu, ja pacienti saņem agresīvu un dārgu vēža ārstēšanu, kas viņus nenogalinās.

Grūtākais ir ne tikai demonstrēt spēju agrīni atklāt vēzi, bet arī iespēja pateikt, ka šīs zināšanas patiešām ir nozīmīgas pacientu iznākuma ziņā, saka J. Leonards Lihtenfelds, Amerikas vēža biedrības galvenā medicīnas darbinieka vietnieks. Es nevaru pateikt, cik reižu mēs esam teikuši: 'Ak, mums atliek tikai laikus atrast katru vēzi, un mēs atrisinātu problēmu.'

Flatlijs piekrīt, ka lielākā daļa skrīninga testu nav palīdzējuši pacientiem un ka daudzi uzņēmumi, kas tos izstrādā, ir cietuši no izmaiņām. Ja paskatās uz šo biznesu, tas ir piesātināts ar neveiksmēm. Viņš saka, ka ar dažiem izņēmumiem skrīninga testi vienmēr ir bijuši briesmīgi. Tas ir liels izaicinājums.

Lai pierādītu agrīnas atklāšanas iespējamību, Flatley saka, Grāls tērēs miljonus klīnisko pētījumu organizēšanai, iesaistot pat 30 000 cilvēku. Tas pārbaudīs tos visus un pēc tam pārbaudīs, vai testi spēj noteikt vēzi agrāk nekā noteiktas metodes.

Flatlijs lēš, ka pētījumiem nepieciešamais DNS sekvencēšanas apjoms būtu līdzvērtīgs aptuveni 400 000 cilvēku genomu augstas kvalitātes dekodēšanai. Tas padara projektu apmēram trīs reizes lielāku par Genomics England, kas ir valsts centieni pētīt vēzi un slimības Apvienotajā Karalistē.

Flatlijs saka, ka viņš uzskata, ka šobrīd Illumina ir vienīgais uzņēmums, kas šobrīd spēj ieviest sekvencēšanas tehnoloģiju par pietiekami zemām izmaksām, lai veiktu šādus pētījumus un laist tirgū lētu testu. Šajā gadījumā mēs nedomājām, ka tirgus varētu to paveikt pietiekami ātri, ja vien mēs neiznīcinām savu [biznesu], atdodot secību, sacīja Fletlijs. Mēs nedomājam, ka kāds cits to var izdarīt lielā mērogā. Un uz spēles ir likti miljoniem dzīvību.

Illumina ir cenas priekšrocības, jo tas katru gadu universitāšu zinātniekiem un citām laboratorijām ražo un pārdod DNS sekvencēšanas instrumentus, ķīmiskās vielas un testu komplektus vairāk nekā aptuveni 2 miljardu dolāru vērtībā. Bet nesen tā ir arī centusies tieši pāriet uz to, kas, pēc tās domām, būs galvenie šo DNS datu lietojumi. 2013. gadā tā samaksāja gandrīz pusmiljardu dolāru, lai iegādātos pirmsdzemdību testēšanas uzņēmumu Verinta (sk. Pirmsdzemdību DNS sekvencēšana), un pagājušā gada augustā paziņoja, ka tā sadarbosies ar investoriem, lai izveidotu plašu DNS lietotņu veikalu, kas paredzēts patērētājiem. (skatiet Inside Illumina's Plans to Lure Consumers with a App Store for Genomes).

Flatlijs saka, ka Grāla mērķis ir visas vēža pārbaude, kas spēj noteikt lielāko daļu vēža veidu, veicot vienu asins noņemšanu, taču viņš saka, ka agrīna plaušu un krūts vēža atklāšana varētu būt pirmie testi, kas nonāks tirgū. Pats Flatlijs saka, ka viņš veica agrīnu testa versiju, kas atgriezās bez problēmām.

Man bija skaidrs, saka Flatlijs. Bet, ja man ir vēzis, es vēlos par to uzzināt.

paslēpties