211service.com
Lielbritānijas valdība izvēlas Illumina, lai sakārtotu 100 000 genomu
Lielbritānijas valdība paziņo, ka tā plāno nolīgt ASV gēnu sekvencēšanas uzņēmumu Illumina, lai sekvencētu 100 000 cilvēka genomu, kas ir lielākais valsts projekts iedzīvotāju DNS atšifrēšanai.
Gēnu mašīna: Illumina sekvencēšanas instruments var atšifrēt genomu vienas dienas laikā.
In normatīvais dokuments ar ASV Vērtspapīru un biržu komisiju Illumina paziņoja, ka tā ir izvēlēta kā vēlamais partneris 100 miljonu mārciņu vērtajam projektam.
Genomics England apstiprināja, ka ir izvēlējusies Kalifornijas uzņēmumu sekvencēšanas projekta īstenošanai. Mēs esam izgājuši “sagatavošanās” procesu, lai atrastu pareizo uzņēmumu, kas veiktu secību, un tagad sāksim detalizētas sarunas, saka Vivjena Parija, Genomics England pārstāve.
Illumina sekvencēšanas instrumenti dominē DNS atšķetināšanas tirgū (skatiet 50 gudrākie uzņēmumi). Parijs saka, ka uz šo darbu ir pieteikušies mazāk nekā pieci citi uzņēmumi, kas ir viens no lielākajiem secības projektiem, kāds jebkad veikts.
Dažas citas valstis arī apsver lielus valsts mēroga secības projektus. Apvienotās Karalistes projekts būs vērsts uz cilvēkiem ar vēzi, kā arī pieaugušajiem un bērniem ar retām slimībām. Tā kā visi briti ir Nacionālā veselības dienesta biedri, projekts paredz, ka DNS datus varēs salīdzināt ar detalizētiem centralizētiem veselības ierakstiem (skatiet sadaļu Kāpēc Apvienotā Karaliste vēlas genomikas nacionālo veselības dienestu).
Lai gan sekvencējamo genomu skaits ir 100 000, kopējais britu skaits, kas piedalās pētījumā, ir mazāks, aptuveni 70 000. Tas ir tāpēc, ka vēža slimniekiem Genomics England plāno iegūt gan viņu iedzimtās DNS, gan vēža vēža secību.
Genomics England šī gada sākumā sāka runāt ar potenciālajiem pretendentiem, tostarp Ķīnas uzņēmumu un Illumina konkurentu BGI (skatiet Ķīnas genoma rūpnīcā). Tajā laikā genoma pabeigšanas vidējās izmaksas bija aptuveni 3000–4000 USD.
Visu 100 000 genomu pabeigšana būtu izmaksājusi vairāk nekā divas reizes vairāk nekā Anglijas Genomics budžetu. Aģentūra decembrī paziņoja, ka plāno izmantot savas spējas sarunās, lai pazeminātu cenas.
Illumina reaģēja, izlaižot jaunu sistēmu Hiseq X Ten, kas, pēc tās teiktā, spētu sekvencēt genomus par USD 1000, šķērsojot ilgi gaidīto cenu barjeru (skatiet Vai Illumina ir pirmais 1000 USD genoms?).
Šī sistēma faktiski ir 10 mašīnas, katra maksā 1 miljonu USD. Pieprasot pircējiem ieguldīt iekārtās vismaz 10 miljonus ASV dolāru, Illumina pārliecinājās, ka tās jaunās sistēmas zemākās izmaksas būtiski neietekmē cenas citās sekvencēšanas tirgus daļās, vienlaikus ļaujot tai piesaistīt lielus valsts mēroga darbus, piemēram, Apvienotajā Karalistē.
Pēc jaunās Illumina sistēmas lietotāju domām, cena par vienu genomu joprojām ir tuvāk 2000 USD nekā 1000 USD.
Parijs saka, ka Illumina veiks secību Anglijas Genomics vārdā un abas pabeigs sarunas nākamo divu nedēļu laikā. Tas ir ārkārtīgi aizraujošs projekts, kas atrodas tehnoloģiju malā. Parijs saka, ka cilvēki to nav darījuši iepriekš. Mēs būsim pie tehnoloģiju robežām.
[Atjauninājums 12.07.14.: Illumina Genomics England vārdā veiks 100 000 genomu sekvencēšanu. Iepriekšējā šī raksta versijā nepareizi teikts, ka Genomics England plānoja secināt 100 000 atsevišķu indivīdu DNS un ka tas pats to darīs ar instrumentiem, kas iegādāti no Illumina.]