211service.com
Pirkstu galu baktērijas: daudzsološs kriminālistikas rīks
Ne tikai mūsu genomi padara mūs unikālus. Baktēriju genoma profils, kas noberž mūsu pirkstu galus un objektus, kuriem mēs pieskaramies, piemēram, datora tastatūrai, nodrošina arī pirkstu nospiedumus, ko varētu izmantot kriminālistikas nolūkos, norāda Kolorādo universitātes Bolderas pētnieki.
Noa Fierers , Robs Naits , un kolēģi atguva baktērijas no trīs indivīdu tastatūrām un vienlaikus sekvencēja lielu skaitu baktēriju genomu.
Pētnieki ekstrahēja baktēriju DNS no daudziem paraugiem, kas ņemti no trim tastatūrām, un no katra parauga sekvencēja vairāk nekā 1400 baktēriju ribosomu gēna kopijas, lai identificētu katra parauga atsevišķās baktēriju sugas, atklājot, ka tās varētu saskaņot trīs indivīdus ar izmantotajām tastatūrām. Pēc tam viņi paņēma tamponus no deviņu dažādu cilvēku datorpelēm. Salīdzinot paraugos atrastās baktērijas ar mikrobu kopienu datubāzi, kas atrastas 270 cilvēku rokās, kuri nekad nebija pieskārušies nevienai no datorpelēm, pētnieki atklāja, ka baktērijas uz katras personas peles ir vairāk līdzīgas tām, kas atrodas uz viņu rokas. uz paraugiem datu bāzē. Fierers atzīmē, ka līdz šim šī metode ir ļoti provizoriska, taču kādu dienu tā varētu būt tikpat precīza kā tādas metodes kā DNS vai pirkstu nospiedumu analīze, viņš saka.
Ideja izmantot mikrobu parakstu personu identificēšanai nav jauna, saka Deivids Relmanis , medicīnas un mikrobioloģijas un imunoloģijas profesors Stenfordas Universitātē. Gadu desmitiem ilgi pētnieki ir domājuši, vai ir iespējams identificēt indivīdus, pamatojoties, piemēram, uz unikālajiem celmiem. Escherichia coli glabājas savās zarnās. Tomēr vēl nesen visas idejas, kas klīda apkārt, nevarēja īsti detalizēti un metodiski izpētīt, saka Relmans.
Dažos pēdējos gados ātrāka un lētāka sekvencēšanas tehnoloģija ir pavērusi ceļu plašiem pētījumiem par dažādām cilvēka organismā sastopamajām mikrobu kopienām, un pētnieki ir izstrādājuši DNS svītrkodus — īsus raksturīgās DNS pavedienus, kas ļauj viegli identificēt sugas. no baktērijām.
Jūs to nevarēja izdarīt burtiski pirms trim gadiem, saka Lance Price , Metagenomikas un cilvēka veselības centra direktors Translācijas genomikas pētniecības institūtā Arizonā.
Daži jaunākie pētījumi par Cilvēka mikrobioma projekts , tostarp viens no tiem pašiem pētniekiem, ir parādījuši, ka mikrobu sastāvs dažādu indivīdu ādā un pat tie, kas atrodami dažādās vienas un tās pašas personas ķermeņa daļās, pastāvīgi atšķiras. Pašreizējais pētījums parāda, ka pat atstātās mikrobiotas atliekas saglabā individualitātes iezīmes, saka Relmans. Viņš atzīmē, ka kā kriminālistikas paņēmiens ir pārāk agrs lietošanai, taču kādu dienu tas varētu kļūt stabils.
Pilnīgāk izstrādāta pieeja, iespējams, varētu sniegt informāciju, ja esošās kriminālistikas metodes neatbilst, saka Mārtiņš Blazers , medicīnas un mikrobioloģijas profesors Ņujorkas Universitātē. Viņš saka, ka, vienkārši notīrot ādu, jūs saņemat vismaz 100 reizes vairāk mikrobu DNS nekā cilvēka DNS, tāpēc mazāk materiālu varētu dot izmeklētājiem spēcīgāku signālu.
Blasers arī atzīmē, ka pirkstu nospiedumus nevar precīzi nolasīt, ja tie ir notraipīti, savukārt izsmērētajos nospiedumos joprojām var būt pietiekami daudz analizējamo mikrobu. Mikrobioms esam mēs — tas ir tikai vēl viens pirkstu nospiedumu veids, tāpat kā genoma DNS esam mēs, saka Blasers, kurš rakstīja pievienoto komentāru par pētījumu, kas abi publicēti The Proceedings of the National Academy of Sciences .
Tomēr līdz šim joprojām ir daudz jautājumu par to, cik precīza tehnika var kļūt. Mēs veicām šos pētījumus kā koncepcijas pierādījumu, saka Fierer. Tagad mums ir jādara smagais darbs.
Pirmkārt, nav skaidrs, vai indivīda mikrobu parakstu var izgūt, ja cita persona ir pieskārusies objektam, no kura tiek ņemts paraugs. Vēl viens atklāts jautājums ir par to, cik stabils patiesībā ir indivīda mikrobioms. Piemēram, antibiotikas maina indivīda baktēriju profilu, lai gan neviens nezina, cik ilgi. Galvenais solis, lai attīstītu nepieciešamo uzticības līmeni, saka Fierers, būs paplašināt mikrobu kopienu datubāzi, kas atrodama indivīdu rokās. Iespēja salīdzināt profilu ar lielu skaitu citu profilu nodrošinās pamatu patiesi atsevišķu elementu iegūšanai.
Tomēr, saka Relmans, pats iemesls, kas padara to sarežģītāku, piešķir tai visu veidu vērtību, kāda DNS nekad nebūs. Piemēram, viņš saka, ka cilvēka mikrobiota var atklāt ne tikai viņa identitāti, bet arī sniegt norādes par to, ko, piemēram, šis indivīds mēdz ēst vai kur viņš vai viņa strādā vai dzīvo, tāpēc pētnieki varētu noteikt, kā mikrobu veidi, kas tiek pārnesti uz ķermeņa, ir atkarīgi no šādiem faktoriem.
Es domāju, ka tas ir procesa sākums, saka Relmans. Bet mums būs nepieciešams daudz vairāk variāciju avotu, lai mēs joprojām varētu redzēt, kā indivīds spīd cauri.