Reto slimību meklētājprogramma, kas pārspēj Google

1940. gadu beigās Merilendas Universitātes Medicīnas skolas profesors izdomāja neparastu frāzi, lai aprakstītu negaidītas diagnozes. Kad aiz muguras dzirdat nagu sitienus, negaidiet, ka ieraudzīsiet zebru, viņš teica. Frāze ir iestrēgusi, un mūsdienās mediķi parasti lieto terminu zebra, lai aprakstītu retu slimību, kas parasti tiek definēta kā tāda, kas sastopama mazāk nekā 1 no 2000 iedzīvotāju.

Retas slimības pēc būtības ir grūti diagnosticēt. Saskaņā ar Eiropas Reto slimību organizācijas datiem 25 procenti diagnožu tiek aizkavēti par 5 līdz 30 gadiem.

Tāpēc nav pārsteigums, ka mediķi meklē efektīvākus veidus, kā veikt šo darbu. Arvien biežāk izmantots palīgs šajā procesā ir meklētājprogramma, parasti Google. Tas ir daļa no iteratīva procesa, kurā mediķis meklētājprogrammā ievada simptomus, pārbauda iespējamo slimību sarakstus un pēc tam meklē papildu pierādījumus par pacienta simptomiem.

Problēma, protams, ir tā, ka parastās vai dārza meklētājprogrammas nav optimizētas šim procesam. Piemēram, Google uzskata lapas par nozīmīgām, ja uz tām ir saistītas citas svarīgas lapas, kas ir sava slavenā PageRank algoritma pamatā. Tomēr maz ticams, ka retajām slimībām pēc definīcijas būs liels atpazīstamība tīmeklī. Turklāt meklēšana, visticamāk, būs saistīta ar atdevēm no visa veida neatbilstošiem avotiem.

Šodien Radu Dragusins ​​no Dānijas Tehniskās universitātes un daži draugi atklāj alternatīvu. Šie puiši ir izveidojuši īpaši pielāgotu meklētājprogrammu, kas veltīta reto slimību diagnostikai, ko sauc AtrastZebra , nosaukums, kura pamatā ir izplatīts medicīnas slengs par retu slimību. Salīdzinot šīs programmas rezultātus ar tiem pašiem meklēšanas vaicājumiem Google tīklā, tie liecina, ka tas ievērojami labāk sniedz atbilstošus rezultātus.

FindZebra maģiskā mērce ir rādītājs, ko tā izmanto, lai meklētu rezultātus. Šie puiši ir izveidojuši šo indeksu, pārmeklējot īpaši atlasītu reto slimību datu bāzu kopu. Tie ietver Tiešsaistes Mendeļa mantojums cilvēkā datu bāze, Ģenētisko un reto slimību informācijas centrs un Orphanet .

Pēc tam viņi izmanto atvērtā koda informācijas izguves rīku Indri meklēt šajā rādītājā, izmantojot tīmekļa vietni ar parasto meklētājprogrammas saskarni. Rezultāts ir FindZebra.

Visbeidzot, viņi salīdzināja FindZebra meklēšanas rezultātus ar to pašu Google meklēšanu, kas tika izmantota tai pašai ierobežotai datu kopai — funkcija, kas ir iespējama ar izvērstiem Google meklējumiem. Dragusins ​​un kolēģi apgalvo, ka Google rezultāti ir ievērojami sliktāki nekā viņu pašu rezultāti.

Piemēram, FindZebra meklēšanas vaicājums Zēns, normālas dzemdības, abu kāju īkšķu deformācija (trūkst locītavas), ātra kaulu audzēja attīstība mugurkaula tuvumā un osteoģenēze biopsijā kā pirmais rezultāts atgriež pareizo diagnozi Fibrodysplasia ossificans progressiva. Tomēr šī diagnoze vispār neparādās neviena veida Google meklēšanas rezultātos.

Tas norāda, ka PageRank algoritms vai vismaz veids, kā Google to ir pielāgojis, nav piemērots šāda veida meklēšanai. Viņi secina, ka mūsu konstatējums, ka FindZebra kopumā pārspēj Google, veicot šo uzdevumu, un jo īpaši, ja tas attiecas tikai uz mūsu kolekcijas vietnēm (Google Restricted), liecina, ka Google ranžēšanas algoritms nav optimāls konkrētajam uzdevumam.

Lai gan tas joprojām ir pētniecības projekts, Dragusin un citi ir padarījuši savu reto slimību meklētājprogrammu publiski pieejamu vietnē www.findzebra.com . Tas noteikti varētu kļūt par vērtīgu instrumentu medicīnas sabiedrībai.

Taču mazāk skaidrs ir tas, kā šo rīku izmantos plaša sabiedrība. Vietnei ir pievienots nožēlojams ziņojums: Brīdinājums! FindZebra ir pētniecības projekts, un tas ir jāizmanto tikai ko veic medicīnas speciālisti.

FindZebra acīmredzot varētu būt hipohondriķa harta. No otras puses, tas attiecas uz jebkuru medicīnas vārdnīcu.

Informēta sabiedrība arvien biežāk apmeklē savus ārstus, bruņojušies ar detalizētu informāciju, kas lejupielādēta no interneta. Jebkurai darbībai, lai uzlabotu šīs informācijas kvalitāti, noteikti ir jābūt nozīmīgai vērtībai.

Atsauce: arxiv.org/abs/1303.3229 : FindZebra: reto slimību meklētājprogramma

paslēpties