Sākas debates, kad pirmsdzemdību testi pārsniedz Dauna sindromu

Ģenētiskā padomniece Emīlija Hārdistija pirms divām nedēļām sēdēja pretī trim Sandjego biotehnoloģiju uzņēmuma Sequenom pārdevējiem. Pārdošanas komanda bija ieradusies, lai iepazīstinātu viņu ar jaunu veidu, kā grūtniecības laikā dziļāk nekā jebkad agrāk ielūkoties augļa genomā.

Sequenom saka, ka tās tests, kas kļuva pieejams šodien, sola vairāk informācijas par jūsu mazuļa hromosomām nekā jebkurš pirmsdzemdību asins analīzes līdz šim. Taču Hārdistijs nekoda. Viņa saka, ka viņas centrs Ziemeļkarolīnas Universitātē, Chapel Hill, neplāno to pasūtīt. Viņa saka, ka nav skaidrs, cik precīzs ir tests, vai pat tas, vai tas patiešām dos labumu vecākiem.

Peļņas un jaudīgu tehnoloģiju vadīti vairāki biotehnoloģiju uzņēmumi paplašina populāros pirmsdzemdību skrīninga testus. Papildus Dauna sindroma meklēšanai viņi sāk pārbaudīt, vai mazuļa 23 hromosomu komplektos nav mazāku pārtraukumu un kļūdu, kas var izraisīt arī smagus, ja reti, iedzimtus defektus. In brošūras, kas paredzētas topošajām māmiņām , Sequenom savu paplašināto testu uzskata par vienīgo pirmsdzemdību asins analīzi, kas analizē katru jūsu jaunattīstības mazuļa hromosomu.

Praksē jaunais tests skenē genomu augstā līmenī, meklējot trūkstošo vai pievienoto DNS. Tāpat kā iepriekšējie testi, tas var noteikt papildu 21. hromosomas kopiju, kas ir Dauna sindroma cēlonis. Bet tas arī atzīmēs jebkuru trūkstošu, dublētu vai nepareizi novietotu DNS gabalu, kas ir lielāks par septiņiem miljoniem ģenētisko burtu — aptuveni 1/20 no hromosomas lieluma.

Tas ir par jebkādu tik lielu izmaiņu noteikšanu, jo tās būs būtiskas, saka Dirks van den Būms, Sequenom galvenais zinātnes un stratēģijas darbinieks. Viņš lēš, ka paplašinātais tests atklātu nopietnu problēmu vienā no katrām 1000 grūtniecībām.

Sequenom saka, ka pašlaik speciālistiem tirgo paplašināto testu, kas maksā aptuveni 3000 USD, taču tas ņem vērā katru grūtniecību. Uzņēmuma vadītāji ir teikuši Volstrītas analītiķiem, ka viņi sagaida, ka paplašinātais tests kļūs par standartu. Lielāko daļu izmaksu segs apdrošināšana.

Jaunie testi nozīmē, ka ikviena māte drīzumā varētu tikt pakļauta ezotēriskiem, progresīviem ģenētiskiem atklājumiem, kādi līdz šim tika piedāvāti tikai specializētās laboratorijās un kuriem bija nepieciešama biopsija vai amniocentēze. Sequenom saka, ka tā neinvazīvais tests, ko sauc par MaterniT Genome, ir līdzvērtīgs kariotipam vai rūpīgai mazuļa hromosomu pārbaudei mikroskopā.

Paredzams, ka turpmākās šādu testu versijas genomu izķemmēs vēl precīzāk, prognozē uzņēmumi. Daixing Zhou, Ķīnas testēšanas uzņēmuma Berry Genomics izpilddirektors, saka, ka viņa uzņēmums gatavo pirmsdzemdību testu palaišanai šoruden, kas atklātu jebkuru subhromosomu kļūdu, kas ir lielāka par diviem miljoniem DNS burtu.

Šādi testi sniegtu vecākiem vēl nepieredzētu informāciju, piemēram, autisma riska gēnus, papildus simtiem retu attīstības traucējumu. Lai gan tas varētu radīt problēmas savlaicīgi aborta veikšanai vai bērna invalīda sagatavošanai, ārstu grupas saka, ka joprojām ir pārāk maz datu, kas pamato testu izmantošanu. Tikko izdotajās vadlīnijās Amerikas Dzemdību speciālistu un ginekologu kongress secināja, ka nevajadzētu veikt regulāru mazāku hromosomu defektu skrīningu.

Lielāku pārdod kā labāku. Uzņēmumi to virza, nevis pacienti un nevis pakalpojumu sniedzēji, saka Ketija Stoll, Vašingtonas štata ģenētiskā padomniece un bezpeļņas ģenētiskā atbalsta fonda locekle. Uzņēmumiem nav saistošas ​​profesionālās vadlīnijas, izlemjot, kādu testu pārdot.

Daži ģenētikas eksperti saka, ka vairāk informācijas iegūšana no pirmsdzemdību DNS ir neizbēgama un, iespējams, laba ideja. Es redzu lielu atzinību, saka Ronalds Vapners, Kolumbijas universitātes profesors, kurš ir sadarbojies ar uzņēmumiem, lai palīdzētu izpētīt to pirmsdzemdību testus. Kāpēc jūs nevēlaties redzēt šīs lietas? Daži cilvēki ir pretīgi, bet tas ir tāpēc, ka tās ir pavisam jaunas domas. Mums vajag vairāk informācijas, nevis mazāk.

Sequenom 2011. gadā uzsāka pirmo precīzo asins analīzi Dauna sindroma noteikšanai. Šo traucējumu izraisa trīs 21. hromosomas kopijas, nevis parastās divas. Kopš tā laika tirgū ir nonākuši pusduci konkurējošu testu. Tāpat kā Sequenom's, viņi visi izmanto ātras sekvencēšanas iekārtas, lai atšifrētu augļa DNS fragmentus, kas atrodas asinīs, kas ņemts no mātes viņas pirmajā trimestrī (skatiet Pārāk daudz informācijas). Analizējot šos fragmentus, ir iespējams noteikt, vai bērnam ir pārāk maz hromosomu vai pārāk daudz.

Ērtās skrīninga pārbaudes ir kļuvušas par panākumiem. Sequenom saka, ka ir veikusi 450 000 no tiem. Bet labāks to ātras ieviešanas rādītājs ir tas, ka amniocentēzes jeb invazīvās biopsijas rādītājs daudzās slimnīcās tikai četru gadu laikā ir samazinājies vairāk nekā uz pusi.

Uzņēmumi ir meklējuši veidus, kā turpināt neinvazīvos testus. Pagājušajā gadā gan Sequenom, gan Natera, cita testēšanas firma, sāka skrīningu, lai noteiktu nelielu skaitu mikrodelāciju vai ļoti specifisku, mazāku trūkstošas ​​DNS fragmentu, kas, kā zināms, izraisa retus, bet nopietnus ģenētiskus apstākļus, piemēram, DiGeorge sindromu, Pradera-Villi. slimība un Cri-du-Chat, kas nosaukts par skarto zīdaiņu skaļo, kaķim līdzīgo raudāšanu.

Visiem šiem sindromiem ir raksturīgi fiziski un intelektuāli traucējumi, taču ārsti sūdzas, ka pārbaudēm ir negatīvās puses, kuras tiek pieminētas reti, tostarp liela iespēja, ka pozitīvs rezultāts būs viltus trauksme. Neeta Vora, Ziemeļkarolīnas Universitātes mātes augļa medicīnas profesore un tās mātes asins skrīninga laboratorijas direktore, saka, ka tas ir tāpēc, ka šie sindromi ir ļoti reti sastopami un skar tikai vienu no 50 000 dzimušajiem. Atkarībā no testa kļūdu īpatsvara tas nozīmē, ka kļūdaini pozitīvi rezultāti var pārsniegt patiesi pozitīvos rezultātus. Ir ļoti grūti konsultēt pacientus, saka Vora.

Piemēram, testēšanas uzņēmums Natera lēš papīrs martā tika publicēts, ka tikai vienam no 20 pozitīvajiem rezultātiem DiGeorge sindroma gadījumā patiešām ir slimība. Uzņēmuma zinātnieks Zaks Demko saka, ka viltus pozitīvo rezultātu rādītājs ir mazāks ar atjauninātu testa versiju. Natera, kas mēnesī pārdod aptuveni 20 000 testu, jūlijā IPO palielināja 180 miljonus USD.

Vora saka, ka viltus pozitīvu rezultātu risks ir tāds, ka daži pacienti un daži ārsti uzskata, ka skrīninga testi ir nepārprotami. Viņi neapzinās, ka pozitīvs rezultāts ir jāapstiprina ar invazīvu testu, piemēram, amniocentēzi. Tas var izraisīt nevajadzīgu trauksmi un ir novedis pie gadījumiem, kad sievietes ir beigušas grūtniecību, kas patiesībā bija veselīga.

Wapner, kurš bija līdzautors Natera papīram, arī vaino uzņēmumus par to, ka tie ir uzsākuši testus, pirms ārējie eksperti ir paspējuši to izvērtēt. Taču Vapners neuzskata, ka kļūdaini pozitīvi rezultāti paši par sevi ir problēma. Viņš atzīmē, ka pirms neinvazīvām asins analīzēm gandrīz katra topošā māmiņa, kas vecāka par 35 gadiem, tika nosūtīta uz amniocentēzi, lai gan iespēja atklāt Dauna sindromu bija viena no 270. Tagad cilvēki saka, ka viens no 20 ir pārāk augsts mikrodelēcijām, viņš saka. Tas ir smieklīgi.

Neinvazīvo testu darbības jomas paplašināšana varētu palielināt pieprasījumu pēc tiem. Dažas medicīnas organizācijas vēl neiesaka veikt dārgas pārbaudes jaunākām sievietēm, pamatojoties uz to, ka Dauna sindroma iespējamība ir ļoti zema. Bet mikrodelecijas sindromi, lai arī tie nav izplatīti, vienādi ietekmē visu vecumu. Tas rada argumentu, lai pārbaudītu arī jaunākas sievietes. Šķiet, ka tie nav saistīti ar vecumu, tāpēc mēs uzskatām, ka tie ir piemēroti visām grūtniecībām, saka Džou, Berry Genomics izpilddirektors.

Sequenom genoma tests atklāj jaunu pamatu, jo atšķirībā no iepriekšējiem testiem, kuros tika meklēta informācija par īpašām medicīniski svarīgām mikrodelācijām, tas skenē visas hromosomas un ziņo par visām atrastajām DNS izmaiņām neatkarīgi no tā, vai tās izraisa slimību. Faktiski Van den Boom nevarēja nosaukt nevienu konkrētu iedzimtu defektu vai slimību, kuras jaunā testa funkcija ir paredzēta.

Bet Van den Boom saka, ka praksē visas konstatētās izmaiņas būs nopietnas, jo uzņēmums ziņos tikai par izmaiņām, kas pārsniedz septiņus miljonus DNS burtu, kas ir aptuveni divas līdz trīs reizes lielākas par mikrodelēcijām, kuras pašlaik meklē testi. Citi eksperti saka, ka šāda izmēra DNS kļūdas var izraisīt nāvi dzemdē vai tik retos gadījumos, kad tām nav vārda.

Sequenom nenoteiktība par to, ko tas patiesībā pārbauda, ​​norāda uz vēl vienu būtisku problēmu: ja ārsti nezina, ko nozīmē DNS kļūdas, kā viņi var konsultēt pacientus? Pat daži labi izpētīti hromosomu bojājumu veidi noteikti neradīs nopietnas veselības problēmas. Voras klīnika Ziemeļkarolīnas universitātē saka, ka tā konsultējusi topošo māti, kuras asinis bija pozitīvas attiecībā uz mikrodelāciju, kas izraisa Angelmana sindromu. Izrādījās, ka mātei bija ģenētiskā kļūda, taču viņa nebija īpaši ietekmēta. Ir cilvēki, kas staigā ar dažām no šīm mikrodelecijām, kuri pat nezina, ka viņiem tās ir, saka Hārdistijs.

Van den Boom saka, ka Sequenom ir arī noraizējies par tādu DNS kļūdu atrašanu, kuru nozīme nav skaidra un kuras var pakļaut pacientus un ārstus informācijai, ar kuru viņi, iespējams, nezina, kā rīkoties, piemēram, autisma riska faktoriem. Viņš saka, ka Sequenom ir apspriedis risku, ka informācija tiks ļaunprātīgi izmantota grūtniecības pārtraukšanai vai ka ārsti pat nezinātu, ko viņi pārbauda. Viņš saka, ka tas ir viens no iemesliem, kāpēc tā noteica robežvērtību septiņu miljonu bāzu apmērā. Mēs vēlamies pārliecināties, ka tam ir klīniska nozīme.

Sequenom jaunais tests maksās par aptuveni 300 USD vairāk nekā 2700 USD tests, ko tas piedāvā vairākus gadus. Van den Boom saka, ka viņš uzskata, ka, iespējams, neinvazīvie testi galu galā tiks izmantoti, lai ziņotu par daudz mazākām kļūdām, kā arī lai diagnosticētu izplatītus iedzimtu slimību gēnus un vielmaiņas traucējumus dzemdē, nevis dzimšanas brīdī. Savukārt Natera IPO laikā investoriem sacīja, ka tā arī saskata dažus tehnoloģiju ierobežojumus. Tā uzskata, ka tā spēj ģenerēt gandrīz visu indivīda genomu aptuveni deviņas nedēļas pēc indivīda ieņemšanas.

Vapneram tas nozīmē, ka šodienas debates par to, vai rūpīgāk aplūkot hromosomas, ir tikai ģenerālmēģinājums dienai, kad būs zināms augļa genoms, burts burtam (sk. 10 Breakthrough Technologies 2013: Prenatal Sequencing). Viņš saka, ka mēs neapšaubāmi varēsim neinvazīvi sekvencēt augli. Vai mums tas jādara, ir cits jautājums.

paslēpties