211service.com
Vēža atlants, lai prognozētu, kā klāsies pacientiem
Izpratne par audzēju ģenētiskajām izmaiņām, kas atšķir nāvējošākos vēža veidus no labdabīgākiem, varētu palīdzēt ārstiem labāk ārstēt pacientus.
Šodien zviedru pētnieki uzsāk jaunu brīvpieejas katalogs kas iezīmē daudzas no šīm ģenētiskajām izmaiņām. Šis atlants saista tūkstošiem specifisku gēnu, kas iesaistīti daudzos vēža veidos, ar pacientu izdzīvošanu, kā arī atklāj iespējamos jaunus zāļu mērķus.
Jaunais atlants ir viens no vairākiem nepārtrauktiem centieniem izprast datus, kas savākti publiskajās datubāzēs, piemēram, Nacionālā vēža institūta vēža genoma atlantā, kas darbojas kā audzēju paraugu glabātavas. Mērķis ir iegūt praktisku informāciju, piemēram, slimības marķierus, ko var izmantot, lai izstrādātu vēža zāles un diagnostiku.
Lai izveidotu atlantu, pētnieki, kurus vadīja Matiass Ulēns, mikrobioloģijas profesors Zviedrijas Karaliskajā Tehnoloģiju institūtā, izmantoja superdatoru, lai analizētu 17 galvenos cilvēku vēža veidus no gandrīz 8000 audzēju paraugiem. Uhlén saka, ka viņa komanda meklēja holistiskas izmaiņas visā genomā, ko izraisīja šīs mutācijas.
Pēc tam viņi kartēja visus šajās vēža šūnās atrastos gēnus, lai noskaidrotu, kā šo gēnu ražotie proteīni ietekmē pacienta izdzīvošanu. Gēni satur instrukcijas olbaltumvielu iegūšanai, un gēnu ekspresijas līmenis palielina vai samazina gēnu radīto olbaltumvielu daudzumu. Šie iegūtie proteīni var dramatiski ietekmēt bioloģiskos procesus, piemēram, vēzi.
Pētnieki novēroja, ka proteīnu līmenis dažādos vēža veidos ir ļoti atšķirīgs, pastiprinot nepieciešamību pēc personalizētas vēža ārstēšanas, pamatojoties uz pacienta audzēja unikālajām īpašībām.
Pētnieki atklāja, ka vairāk nekā 2000 gēnu dažādi ietekmēja pacienta izdzīvošanu atkarībā no vēža veida un audzēja atrašanās vietas organismā. Dažos gadījumos gēni, kas bija izteiktāki, bija saistīti ar labākiem pacientu rezultātiem, bet citi paredzēja sliktākas pacientu perspektīvas. Rezultāti ir detalizēti šodien žurnālā Zinātne .
Ulēns un viņa komanda identificēja vēl vienu vairāk nekā 2000 gēnu kopu, kas potenciāli varētu iznīcināt audzēja augšanu, taču saka, ka, ietekmējot lielāko daļu šo mērķu ar zālēm, pacientiem varētu būt nopietnas blakusparādības. No tiem viņi prognozē, ka 32 gēni, kas atrodami vairāk nekā 80 procentos audzēju, neatkarīgi no vēža veida ir narkotiku mērķi.
Iepriekš pētnieki ir koncentrējušies uz DNS sekvencēšanas izmantošanu, lai identificētu ģenētiskās mutācijas, kas saistītas ar vēzi. Lai izveidotu šo jauno atlantu, zinātnieki izmantoja RNS sekvencēšanu, lai saprastu, kā gēni mainās, ja tos ietekmē vēzis.
Džons Leite, gēnu sekvencēšanas uzņēmuma Illumina onkoloģijas viceprezidents, saka, ka būs nepieciešams daudz bioloģiskās informācijas, lai izprastu pamatā esošos mehānismus, kas veicina vēža veidošanos, un galu galā ļautu pētniekiem un ārstiem paredzēt labākās terapijas iespējas pacientiem. Šeit varētu palīdzēt šis jaunais atlants.
Ņujorkas genoma centra skaitļošanas bioloģijas direktora asistents Nikolass Robins saka, ka atlants būs noderīgs resurss pētniekiem, taču teica, ka tas nevar sniegt galīgu, automatizētu atbildi ārstiem, kuri vēlas uzzināt, kā progresēs pacienta vēzis. Nav tā, ka pievienojat savu izteiksmes profilu un tas norāda, vai jums ir labāks vai sliktāks rezultāts.
atlants ir daļa no Zviedrijas programmas, kas tika uzsākta 2003. gadā ar mērķi kartēt visas cilvēka olbaltumvielas, ko organismā ražo aptuveni 20 000 vai vairāk gēnu.