211service.com
Vēža 'pasaules tīmeklis'
Jau vairākus gadus klīnicisti un datorzinātnieki ASV un ārvalstīs ir mēģinājuši uzlabot vēža aprūpi — no diagnozes līdz ārstēšanai —, veidojot plašas, savstarpēji saistītas datubāzes, kas ir pilnas ar pacientu informāciju. Viņi sauc šīs krātuves par medicīnas režģiem un iztēlojas dienu, kad ārsts Strasbūrā vai Ņūdeli var redzēt, piemēram, ka neatšifrējams pacienta plaušu attēls ir ļoti līdzīgs Sanfrancisko pacienta attēlam, kura slimības vēsture varētu būt par pamatu lēmuma pieņemšanai. veikt biopsiju.
Šajās topošajās datubāzēs ir iekļauta ne tikai pacientu medicīniskā vēsture, tostarp tādi dati kā MRI un CT skenēšana, bet arī informācija par to, kā viņi ir reaģējuši uz zālēm. Taču ieguvumi no šiem jaunbūvējamiem režģiem ir radušies lēni, daļēji tehnisku problēmu dēļ un daļēji tāpēc, ka federālie privātuma noteikumi apgrūtina datu koplietošanu. Tagad Nacionālā vēža institūta projekts varētu pārbaudīt vairāku slimnīcu sistēmu plaušu vēža attēlu salīdzināšanai jau šogad, kas ir skaidrs virziens uz režģu izmantošanu.
Šis stāsts bija daļa no mūsu 2006. gada marta numura
- Skatiet pārējo izdevuma daļu
- Abonēt
Kenets H. Buetovs, institūta Bioinformātikas centra direktors Betesdā, MD, to sauc par pirmo būtisku soli ceļā uz globālo vēža pētījumu tīklu.
Pagājušajā gadā Buetovs un viņa komanda ir savākuši vairāk nekā 50 000 plaušu vēža attēlu, kas iegūti medicīniskajos pētījumos, un arhivējuši tos drošā elektroniskajā repozitorijā NCI. Viņu centieni ir daļa no trīs gadus ilga 60 miljonu ASV dolāru izmēģinājuma projekta, kas tika uzsākts 2004. gadā un kurā iesaistīti 50 vēža centri un vairāk nekā 600 pētnieku. Arhīvs tagad pieejams internetā plkst http://ncia.nci.nih.gov . Papildus citiem attēlveidošanas projektiem tajā ir iekļauta liela plaušu vēža gadījumu kolekcija, kas seko visu to terapijas laiku.
Tā kā datubāze tagad lielā mērā ir izveidota, testēšana ir nenovēršama. Attēlu kolekcija ir paredzēta, lai veicinātu un atvieglotu jaunas programmatūras izpēti, kas var automātiski salīdzināt plaušu attēlus ar tiem, kas jau ir datu bāzē. Šādā programmatūrā algoritmi meklēs kopīgās iezīmes un izveidos visticamāko sakritību direktoriju. Klīnicisti birojos un slimnīcās varēs kontrastēt iegūtos plaušu attēlus ar skenēšanu, kas viņiem ir jānovērtē.
Attēlu salīdzināšana ir tikai pirmais solis. Ja viss noritēs labi, trīs gadu laikā Nacionālais vēža institūts cer veikt vienu vai vairākus klīniskos pētījumus, kuros tiks iegūts milzīgs daudzums medicīnisku datu par plaušu vēzi, tostarp attēli, audzēju veidi, zāļu kursi, pacientu rezultāti, pat plaušu vēža molekulārie profili. slimību – izmantotu ārsti, kuri pēta konkrētus gadījumus. Šo gadījumu rezultāti tiktu salīdzināti ar gadījumiem, kas ārstēti, izmantojot tradicionālās vēža diagnostikas metodes. Šim salīdzinājumam būtu jāsniedz informācija ne tikai par pacientu medicīnisko reakciju, bet arī par to, ar kādu precizitāti ārsti noteica savas diagnozes, un pat par to, cik lielā mērā viņi ievēroja medicīniskās privātuma standartus.
Medicīnas tīkla pētniekiem nav redzes trūkuma. Attēlu salīdzināšana ir tikai pirmais solis. Gadījumos, kad skenēšanas rezultāti sakrīt, ārsti cer, ka varēs dziļāk iedziļināties līdzīgu gadījumu vēsturē un uzzināt, kuras zāles vai operācijas bija vislabākās. Un Buetovs saka, ka viņa pētījumi faktiski varētu paātrināt dienu, kad dažas vēža diagnozes tiek automatizētas. Ārsts varētu ievadīt attēlus (un, režģim paplašinoties, asins analīžu rezultātus, ģenētisko marķieru aprakstus un citus pacientu datus) un uzzināt, cik bieži gandrīz identiski testu rezultāti no pacientiem visā pasaulē korelē ar specifiskiem ļaundabīgiem audzējiem, piemēram, limfomām, melanomām, vai sarkomas.
Un nākotnē, samazinoties gēnu sekvencēšanas izmaksām, NCI tīklā varētu pat iekļaut pacientu genoma informāciju. Tīkla jauda ir tā spējā apkopot un korelēt arvien vairāk sabiedrības veselības datu no visas pasaules, sacīja Marija Kraca no Mičiganas Universitātes Medicīnas skolas, tīkla pētniecības kopienas tehniskā padomniece. Jo vairāk datu jums ir, jo vairāk zināšanu jūs ģenerējat.
Tikmēr ir jāatrisina ikdienišķas tehniskas problēmas.
Tā kā attēliem pievienotie dati dažādās slimnīcās atšķiras pēc veida un formāta, pētnieki izstrādā standarta formātus, kas tos visus var saskaņot. Mēs lūdzam daudzu konkurētspējīgu iestāžu pētniekus nojaukt šķēršļus liela datu apjoma apmaiņai, saka Hovards Bilofskis, Pensilvānijas Universitātes Bioinformātikas centra vecākais līdzstrādnieks, kas piedalās NCI projektā. Iespēja koplietot informāciju režģos visā pasaulē dzīvības zinātnes pētniecības jomā nav viegli izdarāma.